Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TUBA3EQ6PEY2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TUBA3EQ6PEY2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBA3EQ6PEY2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TUBA3EQ6PEY2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBA3EQ6PEY2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TUBA3EQ6PEY2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBA3EQ6PEY2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBA3EQ6PEY2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBA3EQ6PEY2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBA3EQ6PEY2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TUBA3EQ6PEY2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBA3EQ6PEY2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBA3EQ6PEY2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBA3EQ6PEY2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBA3EQ6PEY2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBA3EQ6PEY2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBA3EQ6PEY2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBA3EQ6PEY2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBA3EQ6PEY2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBA3EQ6PEY2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBA3EQ6PEY2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBA3EQ6PEY2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBA3EQ6PEY2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBA3EQ6PEY2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBA3EQ6PEY2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBA3EQ6PEY2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBA3EQ6PEY2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBA3EQ6PEY2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBA3EQ6PEY2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBA3EQ6PEY2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBA3EQ6PEY2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBA3EQ6PEY2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBA3EQ6PEY2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBA3EQ6PEY2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBA3EQ6PEY2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBA3EQ6PEY2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBA3EQ6PEY2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBA3EQ6PEY2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBA3EQ6PEY2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBA3EQ6PEY2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBA3EQ6PEY2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBA3EQ6PEY2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBA3EQ6PEY2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBA3EQ6PEY2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBA3EQ6PEY2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA3EQ6PEY2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA3EQ6PEY2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBA3EQ6PEY2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBA3EQ6PEY2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBA3EQ6PEY2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA3EQ6PEY2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBA3EQ6PEY2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBA3EQ6PEY2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBA3EQ6PEY2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA3EQ6PEY2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA3EQ6PEY2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBA3EQ6PEY2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBA3EQ6PEY2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBA3EQ6PEY2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA3EQ6PEY2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBA3EQ6PEY2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBA3EQ6PEY2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBA3EQ6PEY2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBA3EQ6PEY2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3EQ6PEY2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBA3EQ6PEY2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBA3EQ6PEY2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBA3EQ6PEY2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBA3EQ6PEY2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA3EQ6PEY2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBA3EQ6PEY2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBA3EQ6PEY2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBA3EQ6PEY2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBA3EQ6PEY2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBA3EQ6PEY2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms