Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLIPQ5VWP3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MLIPQ5VWP3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MLIPQ5VWP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLIPQ5VWP3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms