Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EEF1A1P5Q5VTE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EEF1A1P5Q5VTE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms