Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIN1Q13671 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIN1Q13671 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIN1Q13671 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RIN1Q13671 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIN1Q13671 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIN1Q13671 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIN1Q13671 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIN1Q13671 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms