Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1H3Q13133 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1H3Q13133 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR1H3Q13133 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NR1H3Q13133 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NR1H3Q13133 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1H3Q13133 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR1H3Q13133 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR1H3Q13133 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NR1H3Q13133 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NR1H3Q13133 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR1H3Q13133 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR1H3Q13133 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NR1H3Q13133 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NR1H3Q13133 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR1H3Q13133 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR1H3Q13133 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NR1H3Q13133 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NR1H3Q13133 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1H3Q13133 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms