Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NR1H3Q13133 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NR1H3Q13133 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NR1H3Q13133 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NR1H3Q13133 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NR1H3Q13133 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NR1H3Q13133 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NR1H3Q13133 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NR1H3Q13133 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NR1H3Q13133 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NR1H3Q13133 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NR1H3Q13133 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NR1H3Q13133 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NR1H3Q13133 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NR1H3Q13133 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NR1H3Q13133 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NR1H3Q13133 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NR1H3Q13133 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NR1H3Q13133 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NR1H3Q13133 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NR1H3Q13133 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NR1H3Q13133 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NR1H3Q13133 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NR1H3Q13133 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NR1H3Q13133 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NR1H3Q13133 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NR1H3Q13133 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NR1H3Q13133 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NR1H3Q13133 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NR1H3Q13133 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NR1H3Q13133 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NR1H3Q13133 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NR1H3Q13133 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NR1H3Q13133 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR1H3Q13133 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NR1H3Q13133 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NR1H3Q13133 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NR1H3Q13133 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NR1H3Q13133 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NR1H3Q13133 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NR1H3Q13133 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NR1H3Q13133 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NR1H3Q13133 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NR1H3Q13133 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NR1H3Q13133 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NR1H3Q13133 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NR1H3Q13133 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR1H3Q13133 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR1H3Q13133 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR1H3Q13133 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NR1H3Q13133 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NR1H3Q13133 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NR1H3Q13133 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NR1H3Q13133 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NR1H3Q13133 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NR1H3Q13133 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NR1H3Q13133 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NR1H3Q13133 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NR1H3Q13133 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NR1H3Q13133 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR1H3Q13133 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NR1H3Q13133 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NR1H3Q13133 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NR1H3Q13133 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NR1H3Q13133 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NR1H3Q13133 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NR1H3Q13133 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NR1H3Q13133 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NR1H3Q13133 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NR1H3Q13133 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NR1H3Q13133 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NR1H3Q13133 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NR1H3Q13133 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NR1H3Q13133 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NR1H3Q13133 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NR1H3Q13133 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NR1H3Q13133 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NR1H3Q13133 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NR1H3Q13133 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NR1H3Q13133 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NR1H3Q13133 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NR1H3Q13133 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NR1H3Q13133 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NR1H3Q13133 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NR1H3Q13133 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NR1H3Q13133 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NR1H3Q13133 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NR1H3Q13133 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NR1H3Q13133 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NR1H3Q13133 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms