Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXM1Q08050 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXM1Q08050 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXM1Q08050 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXM1Q08050 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXM1Q08050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms