Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELBQ01201 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RELBQ01201 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELBQ01201 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELBQ01201 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RELBQ01201 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RELBQ01201 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RELBQ01201 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELBQ01201 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELBQ01201 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELBQ01201 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RELBQ01201 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RELBQ01201 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RELBQ01201 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RELBQ01201 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELBQ01201 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELBQ01201 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RELBQ01201 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELBQ01201 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELBQ01201 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELBQ01201 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELBQ01201 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELBQ01201 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELBQ01201 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELBQ01201 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELBQ01201 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELBQ01201 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELBQ01201 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELBQ01201 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELBQ01201 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELBQ01201 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELBQ01201 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELBQ01201 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELBQ01201 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELBQ01201 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELBQ01201 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELBQ01201 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELBQ01201 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RELBQ01201 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELBQ01201 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELBQ01201 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELBQ01201 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELBQ01201 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELBQ01201 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELBQ01201 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELBQ01201 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELBQ01201 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELBQ01201 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RELBQ01201 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RELBQ01201 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RELBQ01201 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELBQ01201 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELBQ01201 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELBQ01201 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RELBQ01201 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RELBQ01201 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELBQ01201 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELBQ01201 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELBQ01201 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RELBQ01201 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELBQ01201 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELBQ01201 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELBQ01201 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELBQ01201 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELBQ01201 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELBQ01201 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELBQ01201 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELBQ01201 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELBQ01201 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELBQ01201 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELBQ01201 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELBQ01201 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELBQ01201 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELBQ01201 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELBQ01201 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELBQ01201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELBQ01201 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELBQ01201 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms