Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MDM2Q00987 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MDM2Q00987 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MDM2Q00987 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MDM2Q00987 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MDM2Q00987 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms