Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2AP49459 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2AP49459 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms