Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCHP24723 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCHP24723 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCHP24723 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCHP24723 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCHP24723 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms