Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC18P0CG32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC18P0CG32 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC18P0CG32 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC18P0CG32 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC18P0CG32 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC18P0CG32 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC18P0CG32 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms