Protein–RNA interactions for Protein: O75800

ZMYND10, Zinc finger MYND domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND10O75800 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND10O75800 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZMYND10O75800 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZMYND10O75800 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZMYND10O75800 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZMYND10O75800 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND10O75800 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms