Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNGR3O43761 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGR3O43761 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGR3O43761 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR3O43761 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNGR3O43761 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms