Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNGR3O43761 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNGR3O43761 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYNGR3O43761 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGR3O43761 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNGR3O43761 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNGR3O43761 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNGR3O43761 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNGR3O43761 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGR3O43761 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNGR3O43761 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNGR3O43761 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNGR3O43761 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNGR3O43761 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNGR3O43761 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNGR3O43761 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNGR3O43761 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGR3O43761 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGR3O43761 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNGR3O43761 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNGR3O43761 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGR3O43761 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGR3O43761 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNGR3O43761 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNGR3O43761 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNGR3O43761 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNGR3O43761 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNGR3O43761 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNGR3O43761 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNGR3O43761 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGR3O43761 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNGR3O43761 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGR3O43761 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNGR3O43761 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNGR3O43761 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNGR3O43761 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNGR3O43761 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGR3O43761 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGR3O43761 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNGR3O43761 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNGR3O43761 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNGR3O43761 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGR3O43761 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGR3O43761 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGR3O43761 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGR3O43761 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGR3O43761 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNGR3O43761 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGR3O43761 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGR3O43761 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGR3O43761 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGR3O43761 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGR3O43761 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGR3O43761 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGR3O43761 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGR3O43761 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGR3O43761 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGR3O43761 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGR3O43761 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGR3O43761 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGR3O43761 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGR3O43761 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGR3O43761 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGR3O43761 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNGR3O43761 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNGR3O43761 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGR3O43761 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGR3O43761 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGR3O43761 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGR3O43761 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGR3O43761 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGR3O43761 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGR3O43761 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGR3O43761 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGR3O43761 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGR3O43761 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGR3O43761 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGR3O43761 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGR3O43761 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGR3O43761 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGR3O43761 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNGR3O43761 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGR3O43761 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNGR3O43761 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGR3O43761 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGR3O43761 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGR3O43761 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGR3O43761 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGR3O43761 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGR3O43761 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGR3O43761 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGR3O43761 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGR3O43761 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGR3O43761 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGR3O43761 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGR3O43761 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGR3O43761 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNGR3O43761 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGR3O43761 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGR3O43761 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms