Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF1O43189 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF1O43189 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF1O43189 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF1O43189 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF1O43189 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF1O43189 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF1O43189 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF1O43189 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF1O43189 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF1O43189 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF1O43189 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF1O43189 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF1O43189 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF1O43189 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF1O43189 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF1O43189 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF1O43189 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF1O43189 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF1O43189 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF1O43189 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF1O43189 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF1O43189 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF1O43189 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF1O43189 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF1O43189 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF1O43189 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF1O43189 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF1O43189 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF1O43189 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF1O43189 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF1O43189 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF1O43189 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF1O43189 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF1O43189 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF1O43189 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF1O43189 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF1O43189 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF1O43189 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF1O43189 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF1O43189 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF1O43189 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF1O43189 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF1O43189 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF1O43189 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF1O43189 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF1O43189 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF1O43189 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF1O43189 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF1O43189 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF1O43189 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF1O43189 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF1O43189 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF1O43189 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF1O43189 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF1O43189 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF1O43189 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF1O43189 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF1O43189 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF1O43189 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF1O43189 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF1O43189 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF1O43189 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF1O43189 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF1O43189 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF1O43189 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF1O43189 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF1O43189 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF1O43189 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF1O43189 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF1O43189 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF1O43189 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF1O43189 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF1O43189 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF1O43189 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms