Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP5LA4QPB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP5LA4QPB2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5LA4QPB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms