Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN7Q9Y6W3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN7Q9Y6W3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN7Q9Y6W3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN7Q9Y6W3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN7Q9Y6W3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN7Q9Y6W3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms