Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHLDA3Q9Y5J5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA3Q9Y5J5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.9 ms