Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP4S1Q9Y587 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4S1Q9Y587 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP4S1Q9Y587 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP4S1Q9Y587 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP4S1Q9Y587 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4S1Q9Y587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms