Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED3Q9Y3Q3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED3Q9Y3Q3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED3Q9Y3Q3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED3Q9Y3Q3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED3Q9Y3Q3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms