Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG5Q9UP83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG5Q9UP83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG5Q9UP83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG5Q9UP83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG5Q9UP83 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG5Q9UP83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG5Q9UP83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG5Q9UP83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms