Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STUB1Q9UNE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STUB1Q9UNE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STUB1Q9UNE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STUB1Q9UNE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STUB1Q9UNE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STUB1Q9UNE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms