Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO6Q9UM54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO6Q9UM54 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO6Q9UM54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO6Q9UM54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYO6Q9UM54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO6Q9UM54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYO6Q9UM54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYO6Q9UM54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms