Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRNDQ9UKY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRNDQ9UKY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRNDQ9UKY0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRNDQ9UKY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRNDQ9UKY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRNDQ9UKY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms