Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms