Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL3Q9UH77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL3Q9UH77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL3Q9UH77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL3Q9UH77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL3Q9UH77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms