Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC6Q9UBN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC6Q9UBN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC6Q9UBN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC6Q9UBN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC6Q9UBN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms