Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP1Q9P0U3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP1Q9P0U3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SENP1Q9P0U3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP1Q9P0U3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP1Q9P0U3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SENP1Q9P0U3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP1Q9P0U3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP1Q9P0U3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms