Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLCO1C1Q9NYB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLCO1C1Q9NYB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO1C1Q9NYB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms