Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD2Q9NV79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMTD2Q9NV79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCMTD2Q9NV79 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD2Q9NV79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCMTD2Q9NV79 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCMTD2Q9NV79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD2Q9NV79 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms