Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM140Q9NV12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM140Q9NV12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM140Q9NV12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM140Q9NV12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM140Q9NV12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM140Q9NV12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms