Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms