Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPL44Q9H9J2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRPL44Q9H9J2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MRPL44Q9H9J2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MRPL44Q9H9J2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MRPL44Q9H9J2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MRPL44Q9H9J2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MRPL44Q9H9J2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRPL44Q9H9J2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms