Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4X1

RGCC, Regulator of cell cycle RGCC, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCCQ9H4X1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGCCQ9H4X1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGCCQ9H4X1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGCCQ9H4X1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGCCQ9H4X1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGCCQ9H4X1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGCCQ9H4X1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms