Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM54Q9BYV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM54Q9BYV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM54Q9BYV2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM54Q9BYV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM54Q9BYV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM54Q9BYV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM54Q9BYV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM54Q9BYV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM54Q9BYV2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms