Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PINK1Q9BXM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PINK1Q9BXM7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PINK1Q9BXM7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PINK1Q9BXM7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PINK1Q9BXM7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PINK1Q9BXM7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms