Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT8

SLC25A21, Mitochondrial 2-oxodicarboxylate carrier, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A21Q9BQT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A21Q9BQT8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A21Q9BQT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A21Q9BQT8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A21Q9BQT8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A21Q9BQT8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A21Q9BQT8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A21Q9BQT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A21Q9BQT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A21Q9BQT8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A21Q9BQT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A21Q9BQT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms