Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI7

PSD2, PH and SEC7 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD2Q9BQI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD2Q9BQI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD2Q9BQI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD2Q9BQI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD2Q9BQI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSD2Q9BQI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD2Q9BQI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms