Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAL3ST1Q99999 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAL3ST1Q99999 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAL3ST1Q99999 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAL3ST1Q99999 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAL3ST1Q99999 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAL3ST1Q99999 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAL3ST1Q99999 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAL3ST1Q99999 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST1Q99999 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST1Q99999 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAL3ST1Q99999 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms