Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSG101Q99816 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TSG101Q99816 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TSG101Q99816 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSG101Q99816 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TSG101Q99816 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSG101Q99816 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms