Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRPK1Q96SB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPK1Q96SB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRPK1Q96SB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPK1Q96SB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPK1Q96SB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPK1Q96SB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms