Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP5Q96PP8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP5Q96PP8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP5Q96PP8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP5Q96PP8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP5Q96PP8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP5Q96PP8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP5Q96PP8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP5Q96PP8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP5Q96PP8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms