Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGAP4Q96P64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGAP4Q96P64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGAP4Q96P64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP4Q96P64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP4Q96P64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP4Q96P64 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms