Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA1

POM121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121Q96HA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POM121Q96HA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POM121Q96HA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POM121Q96HA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POM121Q96HA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POM121Q96HA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POM121Q96HA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POM121Q96HA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms