Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDCCAG3Q96C92 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDCCAG3Q96C92 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDCCAG3Q96C92 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDCCAG3Q96C92 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDCCAG3Q96C92 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDCCAG3Q96C92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms