Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP3Q969Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP3Q969Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP3Q969Y2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP3Q969Y2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms