Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM63Q969Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM63Q969Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM63Q969Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM63Q969Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM63Q969Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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