Protein–RNA interactions for Protein: Q969M1

TOMM40L, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40LQ969M1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOMM40LQ969M1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOMM40LQ969M1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOMM40LQ969M1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOMM40LQ969M1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40LQ969M1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOMM40LQ969M1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40LQ969M1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms