Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCE1Q969G3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCE1Q969G3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCE1Q969G3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCE1Q969G3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCE1Q969G3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCE1Q969G3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMARCE1Q969G3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCE1Q969G3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms